Biệt Động Sài Gòn kể về cuộc đời của các chiến sĩ biệt động Sài Gòn, những người thực hiện nhiệm vụ quan trọng trong việc chống lại quân đội Mỹ trong suốt cuộc kháng chiến. Trong đó, các nhân vật chính phải đối mặt với những khó khăn, thử thách về chiến đấu, mất mát, và cuộc sống gia đình trong thời chiến.